<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
Hi Tongtong,<br>
<br>
<blockquote type="cite">in your file <span style="color: rgb(57,
        200, 37); font-family: Menlo; font-size: 11px;" class="">mkdirs.sh</span>, the sub-folder “logs” is included besides “<span style="font-family: Menlo; font-size: 11px;" class=""><font class="" color="#000000">recon</font></span>”
 and “<span style="font-family: Menlo; font-size: 11px;" class=""><font class="" color="#000000">rootTree</font></span>".
<div class="">So the sub-folder “logs” is created at the beginning of job running for each cooked run.</div>
</blockquote>
<br>
Yes it creates logs directory in the mkdir.sh, and my initial intention was to put these log files into corresponding run directory,<br>
but as I mentioned in my previous e-mail, jobs are crashing, because before starting to execute any job command, slurm checks, if std_out and std_err directories exist,<br>
if not it crashes, it even doesn't reach to the point to execute the mkdir.sh. That is why log files were put to the base directory of the pass.<br>
<br>
Now, yes, you can remove logs directory from the mkdirs.sh, and it will create and empty directory for each run.<br>
<br>
Rafo<br>
<br>
<br>
<div class="moz-cite-prefix">On 7/22/19 8:30 PM, Tongtong Cao wrote:<br>
</div>
<blockquote type="cite" cite="mid:2902AC92-D05C-4690-9DC6-CADEA4C03723@gmail.com">
<div class="">n your file <span style="color: rgb(57, 200, 37);
          font-family: Menlo; font-size: 11px;" class="">mkdirs.sh</span>, the sub-folder “logs” is included besides “<span style="font-family: Menlo; font-size: 11px;" class=""><font class="" color="#000000">recon</font></span>”
 and “<span style="font-family: Menlo; font-size: 11px;" class=""><font class="" color="#000000">rootTree</font></span>".</div>
<div class="">So the sub-folder “logs” is created at the beginning of job running for each cooked run.</div>
</blockquote>
<br>
</body>
</html>